Название города в переводе с древнегреческого языка означает «Богом данная». Феодосия была основана греческими колонистами из Милета в VI веке до н. э., а с 355 года до н. э. она входила в состав Боспорского царства. В V веке город перешел под контроль Римской (Византийской) империи, в VI веке был захвачен хазарами, а затем вновь отошел к Византии. На протяжении следующих веков существовал как небольшое селение, попавшее в XIII веке под влияние Золотой Орды. Впоследствии был выкуплен генуэзскими купцами, которые создали процветающий торговый портовый город Каффа, служивший главным портом и центром управления всех генуэзских колоний в Северном Причерноморье. В этот период город переживал свой расцвет. Генуэзцы поддерживали союзнические отношения с золотоордынскими ханами, которые формально являлись верховными владетелями территорий колоний, предоставляя им полное самоуправление.. К середине XV века Каффа превзошла по размерам Константинополь.
В 1771 году русские войска взяли Феодосию приступом, в 1783 году Екатерина II своим манифестом включила весь Крым в состав России, и в 1784 году полуостров был включен в состав Таврической области. В 1787 году во время своего известного путешествия в Крым его посетила императрица Екатерина II. В XIX веке в городе родился, жил и работал великий художник-маринист Иван Константинович Айвазовский, в 1888 году Феодосию посетил А. П. Чехов.
За мужество, стойкость и массовый героизм, проявленный его жителями в годы Великой Отечественной войны, Феодосии было присвоено звание Город воинской славы. Сегодня Феодосия — город-курорт, город-памятник.